L'universo creato da Monolith Soft per Xenoblade è composto unicamente da due enormi corpi appartenenti a due antiche divinità, Kyoshin e Kishin, in conflitto tra loro, che agli albori dei tempi si scontrarono senza che nessuna delle due uscisse vincitrice. I resti senza vita, rimasti immobili ancora in posa da combattimento, sono le uniche terre emerse in uno sconfinato oceano. Con il passare dei secoli sulle due divinità è nata la vita: una rigogliosa vegetazione ha ricoperto gran parte dei due corpi e si sono sviluppate due civiltà evolute, dislocate sula schiena di ciascuna divinità. Coloro i quali vivono su Kyoshin si sono divisi in tre tribù differenti. Gli Homs, razza molto simile a quella umana, che ha creato diversi insediamenti nella parte bassa di Kyoshin, I Nopon, mercanti erranti, e i Nienter, una tribù molto evoluta ormai diventata leggenda, che si dice abbia antiche origini e che risieda nella zona del cuore della gigantesca divinità. Il mondo di Kishin invece è popolato da una razza guerriera ostile al mondo di Kyoshin, formata da macchine da guerra pronte ad annientare le forme di vita organica. In questo contesto è ambientata la storia di Xenoblade: Shulk, il protagonista del gioco, è un Homs orfano dei genitori che è cresciuto nel suo villaggio in tranquillità, fino al giorno in cui un'incursione dell'esercito Kishin non ha distrutto la sua casa e messo in pericolo la vita dei suoi amici più cari. La razza degli Homs è da sempre in possesso di una speciale spada chiamata "Monado", intrisa di un immenso potere, capace di colpire esclusivamente l'armata Kishin. Questa spada non può essere maneggiata da tutti: solo alcuni prescelti possono impugnarla ed utilizzarla nel migliore dei modi. In passato questa spada apparteneva ad un eroe del villaggio di Shulk, Dumban, ma da quando fu ferito gravemente durante una dura battaglia, egli non è più in grado di impugnarla. Quando, durante una nuova ondata di attacchi, Shulk scopre di riuscire a utilizzare la spada divina, parte con i suoi compagni per l'avventura più grande della sua vita, attraverso le diverse regioni di Kyoshin e Kishin, per sconfiggere una volta per tutte la minaccia nemica, attraverso la conoscenza delle antiche leggende del passato, e del misterioso potere della spada Monado, che sembra essere collegata all'antico scontro delle due divinità che hanno dato origine al tutto.

Xenoblade sembra offrire una mappa del mondo di enormi dimensioni. I corpi delle due divinità saranno suddivisi in diverse aree ed il giocatore potrà esplorarle interamente senza che ci siano tempi di caricamento. Il titolo offre una vasta gamma di ambientazioni differenti: vasti campi con spettacolari cascate, ambienti marini ricchi di spiagge e distese d'acqua, città rurali o tecnologicamente avanzate. Il nostro personaggio potrà correre, nuotare e anche effettuare salti dagli enormi dislivelli che le mappe del gioco, decisamente non lineari, offriranno. Gli sviluppatori prometto inoltre che l'esplorazione avrà un peso importante durante i viaggi, grazie alla possibilità di scoprire aree segrete e nuove strade nelle diverse zone. L'ambiente di gioco inoltre è dotato di un ciclo che alternerà giorno e notte, con gli eventuali cambiamenti che il tempo apporterà a tutti gli elementi interattivi del gioco, soprattutto per quel che riguarda i NPC che incontreremo nelle città e nei villaggi. I personaggi non giocabili saranno interrogabili dai giocatori, e molto spesso offriranno nuovi spunti di gioco, con l'introduzione di miniquest secondarie. Un sistema di legami tra i vari personaggi, ci manterrà in continuo aggiornamento sulle varie relazioni che instaureremo con loro, permettendoci, una volta esaudite determinate condizioni, di sbloccare nuovi eventi e scoprire nuovi dettagli sulla loro storia.