L'incipit narrativo di Fusion si rifà ad una delle saghe più controverse del mondo Marvel: Civil War.
Ultima in ordine cronologico d'apparizione Civil War è stata la prima in cui gli eclettici disegnatori statunitensi hanno osato far combattere seriamente tra loro i compagni di mille avventure, Vendicatori su tutti.
Una saga segnata da scontri campali, dalla morte di figure importantissime e da una rivoluzione quasi completa del mondo Marvel, o almeno di una delle sue proiezioni parallele.
Una breve introduzione a quelle che sono le vicende di Civil War è perciò doverosa per render noto a tutti ciò di cui stiamo parlando.
In seguito ad un grave incidente (un'esplosione con oltre seicento morti) occorso nei pressi di una scuola e causato da un mutante di nome Nitro, il governo degli Stati Uniti, spinto dalle forti pressioni popolari, decide di correre ai ripari promulgando l'Atto di Registrazione.
Tale decreto legge obbliga chiunque sia in possesso di poteri “non comuni” a registrare ad una speciale anagrafe appositamente costituita la propria identità e le caratteristiche delle proprie potenzialità, rendendo quindi da lì in poi vano qualsiasi travestimento.
Il mondo dei difensori della legge si divide immediatamente a metà: da una parte i favorevoli (capitanati da Tony Starks, alias Iron Man) e dall'altra i contrari (guidati da Steven Rogers, Capitan America).
Inizia così una guerra bilaterale che vede entrambi gli schieramenti combattersi e contemporaneamente perseverare nella lotta al crimine, con tutte le conseguenze del caso e con le complicazioni e le implicazioni (vedi alleanze non sempre ortodosse) introdotte dall'ascesa di Cap e i suoi a fuorilegge e ricercati.
Per non risultare eccessivamente scontata (molti già sanno come “finisce” la saga “Civil War”) la trama di Ultimate Alliance 2 utilizzerà la saga suddetta solamente come trampolino di lancio prima e come flebile linea guida poi, lasciando al giocatore molte importanti decisioni capaci di modificare completamente l'andamento dello storytelling (enfatizzato da riuscitissime cut scene realizzate con il motore di gioco).
L'incedere narrativo è insomma più che un mero e semplice calco una sorta di continuo “What if..”, in grado di aumentare esponenzialmente la longevità della produzione.